Факультеттер

• Кыргыз филологиясы жана журналистика факультети
• Орус филологиясы факультети
• Дүйнөлүк тилдер жана маданияттар факультети
• Искусство факультети
• Тарых жана социалдык иштер факультети
• Юридика факультети
• Табият таануу, туризм жана агрардык технологиялар факультети
• Бизнес жана менеджмент факультети
• Эл аралык мамилелер факультети
• Кыргыз-Кытай факультети
• Медицина факультети
• Теология факультети
• Эл аралык медицина факультети
• Эл аралык билим берүү программаларынын жогорку мектеби
• Дене тарбия факультети
• Педагогика жана психология факультети
• Дипломдон кийинки үзгүлтүксүз медициналык билим берүү борбору

Колледждер

• Эл аралык билим берүү программалар колледжи
• Медициналык колледжи
• Финансылык-юридикалык коллледжи
• Өзгөн эл аралык медициналык колледжи
• STEM инновациялык колледжи
• Индустриалдык-педагогикалык колледжи

Институттар

• "Арашан" гуманитардык институту
• Чыгыш таануу институту
• Математика, физика, техника жана маалыматтык технологиялар институту

Лицейлер жана гимназиялар

• "Билим" лицейи
• "Ыйман" лицейи
• Кара-Суу гимназиясы
• Ноокат гимназиясы
• "Зирек" башталгыч билим берүү борбору
• №12 Кесиптик лицейи

Департаменттер

• Билим берүүнүн, изилдөөлөрдүн, инновациялардын сапатын өнүктүрүү боюнча стратегиялык пландаштыруу департаменти
• Эл аралык байланыштар департаменти
• Административдик-чарбалык иштер департаменти
• Информациялык технологиялар жана техникалык тейлөө департаменти
• ОшМУнун Бизнес паркы

Борборлор

• Р.Абдыкадыров атындагы маданий-эстетикалык борбору
• Р.Абдыкадыров атындагы фонду
• Коомчулук менен байланыш борбору
• Практика жана карьера борбору
• ОшМУнун квалификацияны жогорулатуу борбору